第一，所持有“正股+權證”的組合的風險不同。由于認購權證和認沽權證對正股的敏感度不同，隨著正股股價的上升，認購權證的價格上升，認沽權證的價格下跌。從“正股+權證”組合的敏感度來看，認購權證會加劇組合的系統風險，而認沽權證會對沖正股股價波動的部分風險。

　　第二，對流通股股東的補償不同。在正股股價下跌時，認沽權證的價格上漲，會對流通股股東的損失給予補償，從而降低流通股股東的盈虧平衡點；而認購權證能讓流通股股東在未來可能的業績增長中分得一杯羹，但是，如果股價貼權，則在短期內不能給流通股股東多少補償。

　　第三，到期價值不同。由于目前股改方案中所包含的權證均以股票結算方式來交割，這將對權證的到期價值產生重大影響。對于認沽權證，如果在快到期時，權證為價內權證，即股價小于行權價，權證的持有者為了行權必然會買進正股，買盤壓力有可能會使股價向行權價靠攏，從而使權證喪失價值；而對于認購權證，在快到期內，若為價內權證，持有者只需準備現金以便向大股東按行權價買進股票，而不會對流通A股的股價產生影響。只不過在行權后，市場上可流通的股票突然增加，投資者想盡快獲利了結的話，正股遭遇短期拋壓，股價必然又會下跌，從而使投資者遭受損失。

　　最后，認沽權證可以讓投資者構建多種投資組合，而認購權證在市場上缺乏做空機制的條件下，只能成為投機者炒作的工具。