其他財政存款是指各級政府財政未列入“國庫存款”“國庫現金管理存款”賬戶核算的各項存款。其他財政存款包括專用基金存款、財政專戶管理資金存款、代管資金存款、特設賬戶存款、其他財政存款未設國庫的鄉（鎮）財政在商業銀行的預算資金存款等。

為了反映和監督各級財政其他財政存款的增減變動及其結存情況，其他財政存款各級財政總預算會計應當設置“其他財政存款”賬戶。其他財政存款該賬戶的借方登記其他財政存款的增加數；貸方登記其他財政存款的減少數；余額在借方，反映各級政府財政持有的其他財政存款數。其他財政存款的主要來源有專用基金收入、財政專戶管理資金收入、應付代管資金及利息收入等。

其他財政收入產生的利息收入，除規定作為專戶資金收入外，其他利息收入都應繳入國庫納入一般公共預算管理。取得其他財政利息收入時，對其他財政存款實際獲得的利息收入金額按不同情況進行處理：第一，按規定作為專戶資金收入的，借記“其他財政存款”科目，貸記“應付代管資金”“財政專戶管理資金收入”等科目。第二，按規定應繳入國庫的，其他財政存款借記“其他財政存款”科目，貸記“其他應付款”科目，將其他財政存款利息收入繳入國庫時，借記“其他應付款”科目，貸記“其他財政存款”科目；同時借記“國庫存款”科目，貸記“一般公共預算本級收入”科目。