一是資金來源單一。中國創業投資基金主要來源于政府或具有政府背景的國有企業等，民間投資較為匱乏。在創業投資發達的美國，其創業投資資金主要來源于私人資本。同時，創業投資機構現有創投資機構組織架構較為單一，創業投資機構融資渠道有限，創業投資機構難以充分調動包括個人、企業、金融機構等多重力量納入風頭網絡。二是退出機制不健全，多層次資本市場有待完善，創投資本難以順利退出，管理層收購、回購等退出渠道運用受到制度性限制。目前，創業投資機構大多數投資都滯留在被投資企業，依靠被投資企業股利分紅形式收回投資，導致風險投資周期拉長、風險增大，創投機構與被投資企業相綁定，難以實現自我增值和發展。三是創投資本管理團隊專業化程度偏低，存在經營短視、盲目跟風投資現象。一些創業投資機構將風險資金用于證券市場短期投機，難以將資金配置到科技企業，也難以將資金用于企業技術創新活動，從而背離了風險投資業務初衷。此外，目前國內創業投資機構規模相對較小，受到資金規模限制，難以通過組合投資實現風險分散，缺乏應對較高風險的能力，導致其資金無法實現快速滾動擴張。

目前，中國金融中介服務存在問題主要有：針對科技創新的擔保機制不完備，創業投資機構知識產權質押等存在較大操作困難，惠及范圍有限；會計師事務所、律師事務所等中介機構在人才、創業投資機構管理等方面存在一定缺陷；部分中介機構缺乏誠信，行業監管相對缺位，導致市場存在誠信真空。