目前，中國給予城投公司和城投債的稅收優惠手段比較單一、稅收優惠力度也較小，無法積極引導和刺激城投公司對投資規模大、經營周期長、稅收優惠見效慢的基礎設施、交通能源和農業開發等項目的投資，也不利于提高稅收優惠的效益。

在目前相關法律還沒有明確給予城投公司所得稅免稅的情況下，地方政府可以根據各地區的實際情況，靈活運用投資抵免、虧損彌補、稅收優惠加速折舊和科技稅收等多種事后優惠方式來加大對城投公司的稅收優惠力度。例如，允許城投公司采用加速折舊、再投資退稅和投資虧損結轉等措施鼓勵城投公司擴大投資。城投公司采用加速折舊法對固定資產計提折舊，稅收優惠從而延緩其納稅時間，相當于地方政府給城投公司提供了一筆無息貸款；城投公司用稅后利潤轉增資本的再投資行為，可按一定比例退還再投資部分已繳納的所得稅稅款，以鼓勵城投公司將所獲利潤用于再投資；城投公司投資的凈資本在一定比例內允許從應稅所得中扣除，并允許在一定年限內向前或向后結轉。

此外，可以采用減免稅前列支和提取公共建設投資基金等方式，鼓勵城投公司在技術創新、節能環保和環境治理等方面的科研投入。城投債是在中國分稅制改革的背景下產生的，稅收優惠要處理好城投債的問題就必須進一步完善分稅制。1.進一步明晰中央政府與地方政府以及各級地方政府之間的事權劃分對于各級政府事權的劃分，應該由中央政府承擔的，在劃分責任時，應明確由中央政府承擔。在發達國家，對各級政府的事權和財權的劃分一般都由憲法和法律作出明確的規定，明確了各級政府的責任，避免了不必要的相互推卸責任和爭取資金的不正當手段。中國應當借鑒發達國家的經驗，完善相關法律法規，以立法形式明確各級政府的事權和財權，硬化預算約束，規范地方政府舉債和擔保行為，加強地方債務的法制化管理。2.完善地方稅收體系，稅收優惠不斷提高地方稅收收入在財政收入中的比重地方政府財政收入不能滿足地方財政支出的需要，是導致地方政府舉債的重要原因。為了防范新的和不合理的地方債務的累積，應當保證地方政府能夠通過正常和規范的收入來源確保其正常的支出需要。要增加地方財政收入，必須完善地方稅收體系，具體措施有：加快地方稅種改革步伐，完善地方稅種；合理配置地方稅種；進一步加強地方稅收征管。3.加大一般性轉移支付力度中央、省和市各級財政都要加大一般性轉移支付力度。從經濟角度看，目前縣鄉財政乏力是中國市場經濟向縱深發展、調整和優化經濟結構過程中所必須付出的代價，在此過程中，上級財政給予必要支持不僅是必要的，而且是完全應該的。